Projets de recherche : Exportation

Le Bangladesh demeure un pays endémique pour le choléra, avec des flambées biannuelles et des épidémies supplémentaires observées lors des inondations, des cyclones ou de toute autre catastrophe naturelle [1, 2]. La maladie touche toutes les tranches d’âge, mais la majorité des décès surviennent chez les enfants [3–6]. Ainsi, la vaccination contre le choléra reste une composante essentielle de santé publique pour la prévention et le contrôle de la maladie [6].

Un problème majeur susceptible de freiner ces efforts est la pénurie mondiale de vaccins anticholériques oraux (VCO), dont seulement 2 à 3 millions de doses sont produites chaque année. Au Bangladesh, on estime à 170 millions le nombre de doses nécessaires sur une période de cinq ans, même en ciblant uniquement les populations à haut risque. À l’échelle mondiale, pour le reste de l’Asie, l’Afrique ainsi que pour Haïti, des millions de doses supplémentaires sont nécessaires pour le contrôle du choléra endémique et épidémique. La demande mondiale en vaccins est donc très élevée.

La bonne nouvelle est qu’il existe désormais une possibilité de production locale de plus de 50 millions de doses au Bangladesh. Compte tenu de cette perspective, une planification de la prévention du choléra par l’utilisation du VCO pourrait permettre de réduire significativement le fardeau de la maladie dans le pays.

Lacune dans les connaissances

Des données supplémentaires sont nécessaires pour lever les incertitudes concernant le fardeau réel du choléra, ainsi que l’impact, la faisabilité et le rapport coût-efficacité des différentes stratégies de vaccination contre le choléra, afin d’enrichir les connaissances existantes. Il est également reconnu qu’il existe un besoin particulier de preuves issues du terrain concernant ces caractéristiques vaccinales dans les contextes d’endémie cholérique, qui représentent une très grande part du fardeau mondial de la maladie [7].

Il est par ailleurs crucial d’identifier des mécanismes de financement pour l’introduction de la vaccination contre le choléra. L’ensemble de ces efforts devrait contribuer à réduire le fardeau du choléra, qui représente à la fois une charge sanitaire et financière importante pour le pays. Des études ont montré que le coût de l’hospitalisation et de la maladie pour le patient et sa famille est environ dix fois plus élevé que le coût du vaccin [8, 9].

Une surveillance nationale à grande échelle est nécessaire afin d’identifier précisément le fardeau de la maladie dans le pays, et ainsi de planifier des mesures de traitement et de prévention appropriées.

Pertinence

Le Bangladesh doit élaborer des stratégies pour l’introduction d’un vaccin anticholérique oral produit localement. Il est donc nécessaire de disposer d’informations claires provenant des parties prenantes nationales sur la stratégie d’investissement contre le choléra au Bangladesh, sur lesquelles pourront s’appuyer les plans futurs.

En outre, des informations sont nécessaires concernant les stratégies de vaccination et les zones devant être couvertes. Avec la disponibilité d’un vaccin produit localement au Bangladesh, des plans de financement et l’identification de bailleurs de fonds seront indispensables pour concrétiser les programmes de vaccination par VCO.

Objectifs

Les objectifs de cette proposition sont les suivants :

Élaborer un plan (incluant la surveillance des zones à haut risque) et identifier des stratégies pour l’introduction du VCO au Bangladesh, en développant un dossier d’investissement contre le choléra fondé sur la situation actuelle.

Identifier un plan de financement pour l’introduction à court terme du vaccin produit localement au Bangladesh.

Méthodes

Nous mettrons à jour l’étude actuelle sur le dossier d’investissement relatif à la vaccination contre le choléra au Bangladesh, précédemment préparée par l’International Vaccine Institute (IVI) en 2009. Cette mise à jour fournira un guide fondé sur des données probantes, utile aux décideurs politiques du Bangladesh pour la prise de décisions concernant l’utilisation du VCO, ainsi qu’à la communauté mondiale de la santé pour l’examen d’un soutien technique et financier à l’introduction du vaccin anticholérique.

Les informations concernant les populations et les zones à vacciner seront également recueillies grâce à la mise en place d’une surveillance nationale du choléra à l’échelle du Bangladesh. Cette surveillance sera conduite dans différents hôpitaux et collèges médicaux publics et privés, situés dans des zones déjà connues pour leur forte charge de maladies diarrhéiques.

Le Bangladesh reste un pays où le choléra est endémique, avec des épidémies biannuelles et des épidémies supplémentaires lors des inondations, des cyclones ou de toute autre catastrophe naturelle. Il touche toutes les tranches d’âge, la majorité des cas mortels concernant des enfants. Par conséquent, la vaccination contre le choléra reste un élément important de la santé publique dans la prévention et le contrôle de la maladie. Au Bangladesh seulement, nous prévoyons que 170 millions de doses seront nécessaires sur une période de cinq ans si seules les populations à haut risque sont ciblées. La demande mondiale pour ce vaccin est élevée, mais la bonne nouvelle est qu’il est désormais possible de produire localement plus de 50 millions de doses au Bangladesh. Dans cette perspective, la planification de la prévention du choléra à l’aide du VCO pourrait permettre de réduire le fardeau de la maladie au Bangladesh.

Le Bangladesh doit élaborer des stratégies pour l’introduction d’un vaccin oral contre le choléra produit localement dans le pays. Il est donc nécessaire que les parties prenantes nationales fournissent des informations claires sur la stratégie d’investissement dans la lutte contre le choléra au Bangladesh, afin de pouvoir établir des plans pour l’avenir. En outre, des informations sont nécessaires sur les stratégies de vaccination et les zones qui doivent être couvertes. Avec la disponibilité d’un vaccin produit localement au Bangladesh, des plans de financement et des bailleurs de fonds seront nécessaires pour concrétiser les plans de vaccination des populations avec le VCO.

Par conséquent, les objectifs de la présente étude sont les suivants :

• Élaborer un plan (incluant la surveillance des zones à haut risque) et définir des stratégies pour l’introduction du vaccin OCV au Bangladesh en développant un dossier d’investissement contre le choléra basé sur le scénario actuel.
• Définir un plan de financement pour l’introduction à court terme du vaccin produit localement au Bangladesh.

Différentes données seront utilisées pour élaborer et recommander jusqu’à trois stratégies optimales pour l’introduction du vaccin oral contre le choléra (OCV), en tenant compte de la demande en vaccins, du budget et de l’impact sur la santé. Pour cette recommandation, nous communiquerons avec différents niveaux du gouvernement du Bangladesh (GoB) et d’autres parties prenantes internes et externes afin de leur présenter notre stratégie préférée et réalisable pour l’introduction du vaccin.

Le choléra reste un problème de santé mondial persistant qui peut être contrôlé grâce à un approvisionnement en eau et à un assainissement adéquats, ainsi qu’à la vaccination orale contre le choléra. Notre projet vise à soutenir le ciblage géographique des interventions de lutte contre le choléra avec quatre objectifs clés :

• la maintenance d’une base de données mondiale sur la surveillance du choléra qui peut être utilisée par les pays et les parties prenantes du GTFCC pour accéder à des sources de données centralisées et comprendre l’épidémiologie du choléra au niveau national et régional ;
• développement d’un pipeline de cartographie statistique, qui produit des cartes mondiales haute résolution de la charge du choléra ;
• fourniture d’un soutien technique en matière d’épidémiologie et de modélisation aux pays et aux ONG dans la lutte contre le choléra ;
• participation aux groupes de travail du GTFCC afin d’élaborer des orientations fondées sur des données probantes concernant la surveillance et l’élimination du choléra, le ciblage des campagnes de vaccination orale contre le choléra et l’identification des zones à forte charge de choléra.

Ce projet soutient les efforts visant à cartographier le fardeau mondial du choléra grâce à la maintenance d’une base de données mondiale sur l’incidence et la mortalité liées au choléra et au développement de méthodes de modélisation statistique permettant de produire des cartes haute résolution du fardeau du choléra. L’équipe chargée de l’étude s’efforce de mettre au point une interface web conviviale pour la base de données sur le choléra afin de permettre aux pays et aux parties prenantes du GTFCC d’accéder à des sources de données centralisées. Les cartes de la charge mondiale servent de base à de nombreuses activités de planification et d’intervention ciblées, telles que les prévisions stratégiques de la demande de vaccins contre le choléra et l’identification des zones sensibles.

Pour cibler efficacement les campagnes de vaccination orale contre le choléra et les interventions WASH visant à lutter contre cette maladie, il est nécessaire de connaître les régions du monde les plus touchées. La base de données mondiale sur le choléra et les efforts de cartographie résultant de ce projet aident les pays et les parties prenantes du GTFCC à caractériser l’épidémiologie du choléra et à cibler leurs efforts de lutte contre cette maladie.

Fardeau

Le choléra est une maladie mortelle qui provoque environ 3 à 5 millions de cas et plus de 100 000 décès chaque année dans le monde. Sur les 1,3 milliard de personnes exposées au risque à l’échelle mondiale, 66 millions se trouvent au Bangladesh, ce qui représente environ 40 % de la population bangladaise. De plus, les mouvements de populations réfugiées accroissent le risque lié à cette maladie.

Le Bangladesh figure parmi les pays les moins avancés (PMA) bénéficiaires de l’aide publique au développement (APD) et, avec l’Inde, possède la plus grande population exposée au risque de choléra. Le diagnostic rapide et la détection précoce des flambées épidémiques sont des éléments clés dans la lutte contre le choléra. Par ailleurs, l’utilisation indiscriminée d’antibiotiques à large spectre constitue une menace supplémentaire en favorisant la résistance antibactérienne (RAB) au sein des populations de Vibrio cholerae.

Lacune dans les connaissances

Les tests microbiologiques sont coûteux en ressources, et la détection des flambées repose le plus souvent sur des signalements peu fiables de cas de diarrhée de type cholérique provenant des hôpitaux locaux. Des avancées en matière de diagnostic, de choix thérapeutiques et de suivi des flambées épidémiques sont indispensables pour progresser vers l’élimination du choléra en tant que menace pour la santé publique d’ici 2030, objectif récemment proclamé par la Task Force mondiale de lutte contre le choléra soutenue par l’OMS.

Pertinence

L’agrégation d’informations cliniques, environnementales et sociétales géolocalisées, collectées pour le développement de systèmes de diagnostic et de prédiction précoce, ainsi que les données supplémentaires recueillies en continu lors du déploiement et de l’exploitation de ces systèmes, constituera une base de données inestimable. Celle-ci pourra être partagée dans le cadre de projets ultérieurs et collaboratifs, et à terme entre différents pays.

Hypothèse

Des avancées significatives dans la compréhension des dynamiques de transmission de Vibrio cholerae résistant aux antimicrobiens au Bangladesh peuvent être obtenues grâce à l’exploitation de données massives et à l’apprentissage automatique, permettant une meilleure prise de décision au niveau des communautés locales afin d’améliorer le diagnostic et le traitement du choléra.

Objectifs

Les objectifs spécifiques de ce projet sont les suivants :

• Développer une solution de diagnostic portable et en temps réel pour les infections cholériques causées par Vibrio cholerae résistant aux antimicrobiens
• Développer un système de surveillance permettant d’identifier les zones à haut risque de flambée épidémique
• Développer une base de données partageable

Méthodes

Des échantillons seront collectés à l’hôpital de Dhaka, au complexe de santé de Mathbaria Thana, à l’hôpital de Cox’s Bazar et dans les camps de réfugiés rohingyas. Immédiatement après la collecte, les échantillons seront soumis à des tests de diagnostic rapide (TDR).

Si un échantillon est positif pour V. cholerae O1 ou O139, un aliquot sera conservé à −80 °C dans les congélateurs de l’icddr,b pour une utilisation ultérieure, et un autre aliquot sera transféré à la North South University (NSU), Bangladesh, pour des analyses complémentaires (Alam et al. 2006a).

Des échantillons d’eau seront également collectés sur six sites pour chacun des lieux suivants : la ville de Dhaka, Mathbaria et Cox’s Bazar. Les souches toxigènes de V. cholerae seront isolées à partir des échantillons de selles et d’eau selon des méthodes de culture standard, puis caractérisées en termes de résistance aux antibiotiques (Alam et al. 2006b, c). Les deux types d’échantillons seront soumis au séquençage du génome par technologie Nanopore.

Mesures de résultats / variables

Grâce à cette collaboration, le présent projet réunit des expertises complémentaires au service de la santé publique. Il permettra la mise en place d’un programme de recherche multidisciplinaire indispensable pour le diagnostic du choléra par séquençage génomique Nanopore, la sélection des traitements, ainsi que la prévision épidémiologique des infections et de la résistance antibactérienne. À terme, ce programme contribuera à l’amélioration de la santé, du bien-être et de la croissance économique du Bangladesh.

L’exploration de données et l’apprentissage automatique semblent offrir une meilleure résolution pour améliorer la précision du diagnostic d’un agent pathogène. Le dispositif portable de séquençage nanopore en temps réel pourrait fournir une solution diagnostique sur le terrain. Nous avons conçu cette étude d’exploration de mégadonnées et d’apprentissage automatique afin d’améliorer le diagnostic et le choix du traitement de l’infection cholérique causée par V. cholerae résistant aux antimicrobiens

Une solution portable de diagnostic en temps réel pour les infections cholériques causées par des souches de V. cholerae résistantes aux antimicrobiens, utilisant l’exploration de mégadonnées et l’apprentissage automatique afin d’améliorer le diagnostic et le choix du traitement.

Contexte

À l’échelle mondiale, le risque de propagation rapide et à grande échelle de petites épidémies de choléra reste important. Plutôt que de s’appuyer sur des approches communautaires à grande échelle, les stratégies de lutte contre le choléra pourraient se concentrer sur la maîtrise proactive des premiers foyers. Les interventions ciblées dans les zones touchées (CATI) reposent sur le principe selon lequel la détection précoce des foyers peut déclencher une réponse rapide et localisée dans le rayon à haut risque autour d’un ou plusieurs foyers afin de réduire suffisamment la transmission pour éteindre l’épidémie ou limiter sa propagation. Les données actuelles confirment l’existence d’une zone spatio-temporelle à haut risque de 100 à 250 mètres autour des foyers touchés pendant 7 jours.

Nous émettons l’hypothèse que l’application rapide des CATI réduira la transmission au sein des ménages et dans un périmètre plus large. Cela se traduira par une incidence réduite dans ce périmètre et une diminution du regroupement des cas. L’approche locale des CATI permettra une recherche active des cas et une mise en œuvre durable des interventions. Cela se traduira par un accès rapide aux soins pour les cas détectés, ainsi qu’une réduction de la mortalité et de la transmission communautaire.

Méthodes

Nous proposons d’évaluer l’efficacité d’une stratégie CATI à l’aide d’une étude observationnelle menée pendant une épidémie aiguë de choléra, avec des mesures clairement définies de l’efficacité de l’ensemble des mesures CATI. En outre, nous avons l’intention d’évaluer la faisabilité, les coûts et le processus de mise en œuvre de cette approche. Le programme CATI mis en place par Médecins Sans Frontières (MSF) comprendra des interventions clés visant à réduire la transmission (notamment des mesures relatives à l’eau, à l’assainissement et à l’hygiène au niveau des ménages, la recherche active des cas, la chimioprophylaxie antibiotique et la vaccination orale contre le choléra à dose unique (OCV)), qui ont pour objectif de réduire rapidement le risque d’infection au sein des ménages et dans le périmètre autour du ménage du cas primaire. MSF décidera du contenu du programme CATI utilisé, du rayon d’intervention et de la stratégie de priorisation appliquée si le nombre de cas dépasse la capacité opérationnelle, en fonction des politiques nationales, du contexte local et des considérations opérationnelles. Dans les scénarios où une vaccination préventive a été récemment menée ou est prévue, le CATI et son évaluation se concentreront sur la mise en œuvre avant et pendant la campagne de masse, ou dans les zones où la couverture vaccinale était insuffisante.

La conception de l’étude repose sur la comparaison des effets des CATI qui offrent une protection rapide pour éviter les générations ultérieures de cas, par rapport aux CATI progressivement retardés. Une analyse de régression sera utilisée pour modéliser l’incidence observée de choléra enrichi positif au TDR en fonction du retard de l’intervention (en jours). Le retard reflétera la force inverse de la réponse rapide. Les groupes, en fonction de leurs retards d’intervention, serviront de contrôles internes.

Les interventions ciblées par zone (CATI) reposent sur le principe selon lequel la détection précoce des clusters peut déclencher une réponse rapide et localisée dans le rayon à haut risque autour d’un ou plusieurs foyers afin de réduire suffisamment la transmission pour éradiquer l’épidémie ou limiter sa propagation.

Nous proposons d’évaluer l’efficacité d’une stratégie CATI à l’aide d’une étude observationnelle menée pendant une épidémie aiguë de choléra, avec des mesures clairement définies de l’efficacité de l’ensemble des mesures CATI. En outre, nous avons l’intention d’évaluer la faisabilité, les coûts et le processus de mise en œuvre de cette approche. Le dispositif CATI mis en place par Médecins Sans Frontières (MSF) intégrera des interventions clés visant à réduire la transmission (notamment des mesures relatives à l’eau, à l’assainissement et à l’hygiène au niveau des ménages, la recherche active des cas, la chimioprophylaxie antibiotique et la vaccination orale contre le choléra à dose unique (OCV)), qui visent à réduire rapidement le risque d’infection dans le ménage et dans le périmètre autour du ménage du cas primaire.

Le CATI a été mis en avant comme un élément majeur du programme de recherche mondial du GTFCC. Par conséquent, mener une évaluation prospective rigoureuse de l’efficacité du CATI, qui inclut l’OCV et explique le cheminement vers l’impact, est une question importante et opportune pour le contrôle des épidémies.

Objectif

Évaluer l’efficacité de l’approche d’intervention ciblée par zone (CATI) dans la réduction de l’incidence des nouveaux cas lors d’épidémies de choléra. Ce faisant, déterminer les facteurs qui favorisent une mise en œuvre et des interventions optimales des CATI en vue de réduire le choléra dans les contextes humanitaires et les États fragiles.

But

L’objectif principal est de caractériser la relation entre le délai d’activation de la CATI (temps écoulé entre la présentation du cas dans un centre de traitement du choléra et le début de l’intervention CATI) et l’incidence du choléra dans la zone couverte par les interventions CATI. Les objectifs secondaires sont les suivants :

• Documenter les procédures de mise en œuvre des CATI et formuler des recommandations afin de maximiser leur impact lors de futures épidémies de choléra.
• Décrire l’intégration des activités liées à l’eau, à l’assainissement et à l’hygiène (WASH) et à la santé mises en œuvre via les CATI.
• Caractériser la relation entre l’exhaustivité des CATI (en termes de couverture dans la zone géographique spécifiée et d’activités mises en œuvre au sein des ménages) et l’incidence des nouveaux cas de choléra.
• Estimer l’efficacité des CATI à l’aide de paramètres secondaires (par exemple, incidence déclarée de la diarrhée, chlore résiduel libre (FCR) dans l’échantillon d’eau potable, et connaissances et pratiques visant à prévenir la transmission du choléra).
• Documenter les mécanismes de coordination entre les ministères, les agences des Nations unies (ONU), les clusters et les organisations non gouvernementales (ONG) et formuler des recommandations pour la coordination des interventions futures.
• Conception de l’étude

La recherche proposée sera menée

La recherche proposée sera menée lors de futures épidémies de choléra survenant dans des contextes humanitaires reconnus dans au moins deux pays différents ; les lieux seront sélectionnés en fonction de l’endroit où les épidémies de choléra se produisent et de la présence d’un partenaire de mise en œuvre du CATI. Les organisations qui mettent fréquemment en œuvre des interventions CATI lors de la lutte contre le choléra et qui ont accepté de s’associer à la JHSPH comprennent Action contre la faim, Solidarités International et Medair. Les pays en situation d’urgence humanitaire qui présentent un risque élevé d’épidémies de choléra sont notamment la République démocratique du Congo, le Nigeria, l’Éthiopie, le Mozambique et le Yémen, mais d’autres contextes humanitaires pourraient servir de lieu de recherche si une épidémie de choléra se déclarait et si l’un des partenaires de mise en œuvre susmentionnés intervenait avec une intervention CATI.

L’IRB de la JHSPH a classé cette étude comme une recherche ne portant pas sur des sujets humains. L’autorisation du gouvernement ou de l’IRB sera obtenue avant la conduite de la recherche.

L’équipe de recherche se rendra sur place dès que possible après la documentation du premier cas de choléra et commencera la collecte de données dès que possible. Si le déplacement vers le lieu de l’étude n’est pas possible pour des raisons de sécurité, l’équipe de recherche de la JHSPH mènera l’étude à distance par l’intermédiaire de l’organisation partenaire qui fournit une réponse CATI sur le terrain à l’épidémie de choléra.

Étant donné que l’objectif de la recherche est d’évaluer les CATI mis en place par les ONG en réponse à une épidémie de choléra, il n’est pas possible de recourir à un plan d’étude randomisé. Nous nous appuierons donc sur des groupes de comparaison qui se formeront naturellement, en fonction de l’ampleur de l’épidémie et des capacités de l’organisation d’intervention. Cela nécessitera une approche d’échantillonnage flexible.

Nous prévoyons que la comparaison principale portera sur la mise en œuvre rapide ou tardive des CATI (par exemple, à la fin de l’épidémie) ; toutefois, il est également possible que des zones où les CATI ne sont pas mises en œuvre soient utilisées comme groupe de comparaison [dans les épidémies où les capacités sont insuffisantes pour répondre à tous les cas]. D’autres points de comparaison peuvent inclure le délai entre la présentation du cas et la mise en œuvre du CATI : par exemple, CATI mis en œuvre dans les 24 heures, dans les 2 jours, dans les 3 jours, dans les 4 jours, etc.

La recherche proposée est une étude observationnelle des interventions mises en œuvre par des ONG en réponse à des épidémies de choléra (c’est-à-dire qu’aucune intervention n’est proposée). L’étude comprendra les éléments suivants :

• Observation de la mise en œuvre du CATI
• Entretiens avec des informateurs clés : 1) membres du personnel des ONG chargés de la mise en œuvre du CATI afin de caractériser les forces et les faiblesses perçues de l’intervention, la sélection des ménages, les processus logistiques et les défis liés à la mise en œuvre ; 2) responsables des interventions humanitaires des ONG partenaires, des agences des Nations unies, des gouvernements nationaux et d’autres organisations engagées dans la lutte contre le choléra afin de déterminer les perceptions de l’intervention, de la coordination et de la mise en œuvre du CATI.
• Listes des établissements de traitement du choléra : les informations issues des listes des établissements de traitement du choléra sont utilisées pour planifier les interventions CATI, dans le cadre desquelles chaque personne figurant sur la liste (c’est-à-dire chaque cas de choléra) reçoit la visite d’une équipe CATI à son domicile. L’équipe de recherche de la JHSPH demandera les listes aux établissements de santé [qui pourront être complétées par l’équipe de recherche] afin d’évaluer la couverture des interventions CATI.
• Enquête de suivi : l’enquête de suivi auprès des ménages sera menée environ 14 jours après la présentation du cas suspect de choléra dans un centre de traitement du choléra. La méthode d’échantillonnage exacte dépendra de la densité de logement dans la communauté et de la stratégie de mise en œuvre du CATI. Les enquêtes auprès des ménages porteront sur la réception de l’intervention CATI, la composition des ménages, l’incidence de la diarrhée et la recherche de soins pour la diarrhée parmi les membres du ménage depuis la mise en œuvre du CATI (ou la présentation du cas s’il n’y a pas eu de CATI), les connaissances et les pratiques en matière d’hygiène et l’observation du niveau de chlore libre (FCR) dans l’eau potable stockée.

Le choléra continue de représenter une menace majeure pour la santé publique mondiale et constitue un indicateur d’inégalité et de pauvreté, car il reflète le manque d’accès aux infrastructures de base en matière d’eau et d’assainissement. Le risque de propagation du choléra est particulièrement élevé dans les situations humanitaires et les contextes fragiles.

Le risque de transmission du choléra est plus élevé pour les membres du foyer où un cas de choléra a été détecté et pour les foyers voisins. Les interventions de masse visant à contenir les épidémies de choléra ne sont pas efficaces en termes de ressources.  Les interventions préventives ciblant les ménages touchés par le choléra et leurs voisins se sont avérées efficaces lors des épidémies passées. Ces interventions sont souvent appelées « interventions ciblées dans les zones touchées » (CATIs). Les CATIs comprennent principalement des activités liées à l’eau, à l’assainissement et à l’hygiène (WASH), mais peuvent également inclure la surveillance épidémiologique et des services de santé (cliniques), principalement la vaccination orale et la chimioprophylaxie antibiotique.

Il existe peu d’études sur les meilleures pratiques et l’efficacité des CATI dans les contextes humanitaires. Cette étude vise à identifier les facteurs qui favorisent la mise en œuvre et les interventions optimales de ces CATI pour réduire le choléra dans les contextes humanitaires et les États fragiles. La conception de l’étude est axée sur l’observation des activités CATI des organisations partenaires qui interviennent en cas d’épidémie de choléra dans des contextes humanitaires ou fragiles connus.

Il existe peu de données sur les mécanismes, la composition, les interventions, le calendrier et l’efficacité des CATI dans les contextes humanitaires. La recherche proposée sur les CATI dans les contextes humanitaires se concentrera sur les variations dans la mise en œuvre et le calendrier des CATI, le suivi et l’évaluation, ainsi que la coordination et l’intégration, dans le but d’élargir les données disponibles pouvant être utilisées pour éclairer l’élaboration de directives opérationnelles pour les interventions CATI dans la lutte contre le choléra.

Contexte

Les épidémies de choléra sont fréquentes dans les pays à faible revenu touchés par des crises humanitaires concomitantes. Les évaluations de ces interventions épidémiques restent largement inédites et il est nécessaire de générer des données probantes sur les efforts déployés afin d’éclairer les programmes futurs. Cette étude des interventions de MSF face à l’épidémie de choléra visait à décrire les principales caractéristiques des épidémies de choléra et des interventions connexes dans ces trois pays, à identifier les défis liés à l’efficacité et à la faisabilité des différentes stratégies d’intervention sur la base des données disponibles, et à formuler des recommandations pour les pratiques et les politiques de prévention et de contrôle des épidémies.

Méthodes

Des études de cas provenant de la République démocratique du Congo, du Malawi et du Mozambique ont été sélectionnées à dessein par MSF pour cette analyse en raison du fardeau documenté du choléra dans chacun de ces pays, de la fréquence des épidémies de choléra et du risque de crises humanitaires concomitantes. Des données ont été extraites sur les caractéristiques des épidémies, le délai entre l’alerte et la réponse, et la mise en œuvre des interventions en matière de santé et d’eau, d’assainissement et d’hygiène (WASH). Une théorie du changement pour les programmes de réponse au choléra a été élaborée afin d’évaluer les facteurs qui ont influé sur la mise en œuvre des interventions.

Résultats et conclusions

Au total, 20 rapports sur les interventions épidémiques ont été identifiés, dont 15 en RDC, un au Malawi et quatre au Mozambique. Tous ces contextes ont connu des crises humanitaires concomitantes, qu’il s’agisse de conflits armés ou de catastrophes naturelles. Dans les trois pays, le délai médian entre la date de l’alerte et la date du début de l’intervention par MSF était de 23 jours (IQR 14-41). Presque toutes les interventions ont ciblé l’ensemble de la communauté et toutes ont mis en place un traitement hospitalier des cas suspects de choléra dans des établissements de santé existants ou dans des unités temporaires de traitement du choléra (CTU). Dans trois cas, les interventions ont été menées sous forme d’interventions ciblées dans la zone touchée (CATI) et dans quatre cas, elles ont ciblé les ménages des cas suspects de choléra admis à l’hôpital. Les CATI ou les interventions auprès des ménages des cas suspects admis à l’hôpital n’ont eu lieu qu’à partir de 2017. Au total, 74 facteurs affectant la mise en œuvre ont été identifiés dans les différents rapports, notamment des retards dans la livraison des fournitures, des quantités insuffisantes de matériel pour une mise en œuvre efficace du programme et une coordination limitée ou inexistante avec les autorités locales ou d’autres agences. Sur la base de cet examen, les recommandations suivantes sont formulées afin d’améliorer les efforts de prévention et de contrôle du choléra : mener des évaluations rigoureuses et structurées des programmes de lutte contre le choléra ; explorer des modèles améliorés de préparation aux épidémies, notamment la mobilisation rapide des fournitures et le déploiement de personnel qualifié ; investir dans les partenariats avec les autorités nationales et locales et d’autres agences et les renforcer dans le cadre des activités de préparation aux épidémies ; et normaliser les modèles de rapports au sein des pays et entre eux afin de fournir des données cohérentes et accessibles au personnel interne et externe et de rassembler les enseignements tirés.

Sur la base de cette analyse, les recommandations suivantes sont formulées afin d’améliorer les efforts de prévention et de contrôle du choléra : mener des évaluations rigoureuses et structurées des programmes de lutte contre le choléra ; explorer des modèles améliorés de préparation aux épidémies, notamment la mobilisation rapide de fournitures et le déploiement de personnel qualifié ; investir dans les partenariats avec les autorités nationales et locales et d’autres agences dans le cadre des activités de préparation aux épidémies, et les renforcer ; et normaliser les modèles de rapport au sein des pays et entre eux afin de fournir des données cohérentes et accessibles au personnel interne et externe et de rassembler les enseignements tirés.